103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1979 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  289  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
179 aa  247  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
179 aa  245  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
179 aa  245  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
179 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
304 aa  244  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  98.37 
 
 
304 aa  240  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  37.76 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.43 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  34.51 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
175 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.61 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
156 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
186 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  22.5 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  27.14 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  32.53 
 
 
170 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
170 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
167 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
153 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  27.14 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  26.14 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  27.72 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.39 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  27.38 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  27.38 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
160 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 
157 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>