251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1152 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 		 304 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  346  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  99.19 
 
 		 144 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  32.61 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1978  MarR family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 43 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.536119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.97 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.39 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.51 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.03 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.51 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  27.01 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 303 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.06 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>