More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3334 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  38.69 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  44.96 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  38.99 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  31.62 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.15 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  28.79 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.73 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.7 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  32.08 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28.83 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>