208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3190 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  340  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  39.26 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 151 aa  88.2  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  31.47 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  35.77 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  29.85 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4468  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160154  normal  0.0294539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  27.41 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.3 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>