220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1794 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.26 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  29.79 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 164 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.09 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0337  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 150 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 158 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 158 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 142 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  30.7 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  26.49 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.01 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 137 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>