172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0337  putative transcriptional regulator  84.67 
 
 
149 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  34.23 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  34.23 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  27.59 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.54 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  30.17 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  30.7 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
180 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.17 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
177 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
159 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  32.76 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  34.26 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
170 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
148 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>