251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1122 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  43.26 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.53 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  28 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.65 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  36.29 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  33.8 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  29.13 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.37 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1979  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.29 
 
 		 304 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.81 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  21.95 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>