More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1198 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 185 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  49.67 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  50.99 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  40.6 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  43.15 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  33.08 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 171 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  31.71 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  27.07 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  27.01 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  37.89 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  37.89 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  37.89 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.07 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  37.89 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  37.89 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  32.48 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>