102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7681 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7681  CbaR  100 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  33.13 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  32.2 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  26.62 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.79 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 321 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  19.29 
 
 		 168 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  21.57 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 179 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  20.74 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  24.78 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  22.11 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>