More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5564 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  100 
 
 
178 aa  352  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  71.25 
 
 
165 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.22 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.85 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  36.84 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  31.88 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  31.88 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  31.88 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  35.09 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  33.85 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  33.85 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  32.79 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.42 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
139 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.8 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 
144 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
147 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
145 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
145 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 
144 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  40.79 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.09 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
163 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
181 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
163 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
172 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  38.27 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
149 aa  51.2  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
150 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
303 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>