More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0728 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 171 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  77.22 
 
 		 171 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  36.69 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.2 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  32.26 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  30.47 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1152  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2122  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0908  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0252  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1960  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  27.59 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  22.39 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  24.63 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  24.62 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  24.39 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 309 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.17 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.5 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 309 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>