280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1537 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
144 aa  293  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
144 aa  130  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 
145 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.41 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
159 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
165 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
162 aa  50.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
164 aa  48.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  31.71 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.13 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  26.85 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  27.03 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  21.01 
 
 
150 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 
140 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
149 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
145 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
156 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  33.87 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  29.79 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>