More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5723 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  296  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
159 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
178 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
159 aa  60.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  28.89 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  25.71 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  20.15 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  20.15 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  28.47 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  20.15 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  20.15 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  19.4 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  19.4 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.77 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  19.4 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
174 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 
186 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
195 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
147 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>