More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4536 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  333  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 155 aa  197  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 197 aa  183  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 151 aa  178  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  35.1 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  34.78 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.92 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.54 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.54 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  41 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.88 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.63 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.07 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  39.81 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  44.59 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  35.94 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  44.59 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.92 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.36 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  46.07 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.5 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>