More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1882 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.17 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  28.39 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  27.94 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  21.88 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  21.88 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>