More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4436 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  97.2 
 
 		 143 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  278  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  52.14 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  29.17 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  28.46 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.43 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  38.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>