More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3861 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  276  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.45 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 310 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.1 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 186 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  36.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  31.18 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32.84 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.69 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.89 
 
 		 312 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.79 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.79 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 314 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>