207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1463 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.27 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  35.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  36.36 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.59 
 
 		 316 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  26.8 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  30.97 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  24.55 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  21.24 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  21.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  20.35 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>