More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5772 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  78.17 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  75.18 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 144 aa  204  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  69.57 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  69.57 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.2 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.77 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.22 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.2 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>