More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0045 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  95.07 
 
 
142 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
142 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  45.6 
 
 
154 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  39.39 
 
 
137 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  37.17 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  37.72 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  44 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
196 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
160 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 
187 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
190 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.58 
 
 
287 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  36.22 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.45 
 
 
146 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  38.96 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.45 
 
 
146 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35.45 
 
 
146 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.07 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>