More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3868 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  92.31 
 
 		 143 aa  269  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 143 aa  267  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  57.55 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  57.55 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  51.82 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.77 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.55 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.18 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.48 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.02 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 146 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>