More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0962 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  299  9e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  33.81 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  34.55 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  28.03 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  22.66 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
164 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  25.38 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.61 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  27.34 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.73 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  27.4 
 
 
158 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  27.34 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  22.02 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
151 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  25.84 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  24.53 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  28.57 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25.71 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  23.48 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.19 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.25 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.25 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
157 aa  47.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  36.67 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  18.37 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  26.03 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 
193 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  27.85 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  23.64 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>