More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6224 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  77.37 
 
 		 144 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  75.52 
 
 		 152 aa  208  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  67.38 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  67.38 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 143 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 143 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  29.41 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.77 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  33.91 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.25 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  24.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  25.89 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.01 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>