More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2838 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 137 aa  199  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.69 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  39.8 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  35.2 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  25.56 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  33 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  39.78 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.48 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.12 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  34.74 
 
 		 167 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>