More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1555 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  28.57 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  28.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  37.25 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  27.48 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.48 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.27 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.28 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.67 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  33.94 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>