More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2294 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 143 aa  217  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 143 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 143 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  75.56 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 138 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  75.36 
 
 		 138 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 138 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 138 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  74.45 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 139 aa  206  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  75 
 
 		 138 aa  206  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.09 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.96 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.8 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.88 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  31.9 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.91 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.85 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  28.68 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.71 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>