More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3933 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  300  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  72.22 
 
 		 145 aa  220  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 156 aa  86.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 149 aa  66.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.29 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  32.41 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.51 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.71 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.73 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  27.82 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  30.46 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  27.07 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  29.46 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 164 aa  57  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  26.13 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  27.87 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>