More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0747 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  326  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  29.38 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.38 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  31 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25.2 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  25.2 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  20.77 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  22.7 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  27.83 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  23.44 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  25.58 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  29.59 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.59 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>