More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3893 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  320  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.51 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.51 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.05 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  32.47 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  29.49 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 345 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  25.74 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  25.74 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  25.74 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 309 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  25.64 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.18 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.95 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  29.52 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>