215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1816 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  32.08 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.44 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  26.9 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 345 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  31.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 138 aa  47.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25.38 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  20.57 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  21.55 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  22.41 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  22.41 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  26.04 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  26.36 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  30 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  26.45 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>