More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2273 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
183 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  29.75 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  28.08 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  34.95 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  28.68 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  26.5 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  36.49 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.3 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  24.81 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.79 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  25.58 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
165 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  28.69 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
141 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
171 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.94 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
149 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
149 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>