More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30420 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  310  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  37.04 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  41.84 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.89 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.53 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  39.78 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.62 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.62 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.71 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.71 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.31 
 
 		 319 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  38.64 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.83 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  34.07 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.92 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>