More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1797 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  38.95 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.93 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  25.62 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>