191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1443 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 148 aa  290  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2804  MarR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000371866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  21.95 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  21.24 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  28.4 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  32.43 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 340 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 326 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  18.4 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  20.97 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>