77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1482 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  292  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
148 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  29.92 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  34.65 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 
296 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  21.8 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  28.83 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  25 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  22.96 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  22.96 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  22.96 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.63 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  22.96 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3318  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  22.96 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
142 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
145 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  21.99 
 
 
143 aa  40.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  25.2 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.4 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
183 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
143 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
157 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
143 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>