114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0635 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  87.59 
 
 		 139 aa  236  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  87.59 
 
 		 139 aa  236  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  36.08 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  36.08 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  36.08 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 296 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.81 
 
 		 177 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  27.62 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.12 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  22.41 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  28.7 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25.71 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  26.6 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 183 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  27.2 
 
 		 287 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 144 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  28.92 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  24.53 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  28 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>