68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1133 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  87.59 
 
 
139 aa  236  6.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
296 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  27.62 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.69 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.69 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.69 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  27.91 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  25.47 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.93 
 
 
139 aa  43.9  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.01 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 
145 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
144 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
164 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
131 aa  40.8  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
131 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
131 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
131 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
131 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.05 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
144 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 
140 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>