75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1034 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
176 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 
176 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  40.82 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  33.33 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.55 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.5 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
313 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  26.24 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  24.03 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  36.56 
 
 
163 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  30.69 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
314 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  36.9 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  28.89 
 
 
206 aa  44.3  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  28.87 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  46.94 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  30.36 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.43 
 
 
326 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
150 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
310 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 
174 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
188 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
186 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
329 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
309 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 
139 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>