69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4139 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  343  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  91.43 
 
 		 175 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  53.96 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.87 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  26.63 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  24.19 
 
 		 214 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 340 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 313 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  23.47 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 334 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  23.6 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  23.53 
 
 		 283 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 347 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  23.72 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  26.09 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 		 349 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 		 165 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  24.04 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 161 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  23.53 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.82 
 
 		 312 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  22.13 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>