180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0190 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 329 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  37.35 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.7 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  34.57 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.7 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.7 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.7 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28.28 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  30.93 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  26.03 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 326 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  26.81 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  26.42 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  28.21 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  25.47 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  25.47 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  35.29 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.94 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>