121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1175 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 152 aa  302  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  53.24 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  35.61 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 334 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.73 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  29.87 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 340 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 191 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 340 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.54 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 347 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 349 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.3 
 
 		 349 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 178 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 313 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>