86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5348 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  266  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  69.01 
 
 
148 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  76.3 
 
 
155 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
145 aa  137  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  53.54 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  52.31 
 
 
145 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
156 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
141 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 
149 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
153 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  51 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
162 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 
145 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  41.27 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  38.21 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  31.18 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
160 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  39.06 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  26.09 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  37.14 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.84 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
167 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
158 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.53 
 
 
325 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
164 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
155 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>