More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2862 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 
212 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  48.5 
 
 
214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  48.5 
 
 
212 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
212 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
212 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
212 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 
270 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
270 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
213 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
212 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 
212 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
200 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
200 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
145 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
197 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
207 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
196 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  27.75 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  33 
 
 
136 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  33 
 
 
136 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
136 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
146 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
136 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  32 
 
 
136 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
143 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
136 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
147 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
155 aa  54.7  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
171 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  31.29 
 
 
186 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  31.16 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
143 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
145 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 
187 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
159 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  30.97 
 
 
147 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  29.17 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  33.77 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.62 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.25 
 
 
157 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  29.17 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
149 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
155 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.53 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
142 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
155 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 
187 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
142 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
158 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
142 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
142 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>