178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3929 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  91.98 
 
 		 214 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  81.52 
 
 		 212 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  81.52 
 
 		 212 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  81.52 
 
 		 212 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  80.57 
 
 		 212 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  80.57 
 
 		 212 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  80.09 
 
 		 212 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  79.25 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  79.25 
 
 		 270 aa  351  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  78.3 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  78.3 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  78.3 
 
 		 270 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  78.3 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 212 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  78.89 
 
 		 200 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  78.89 
 
 		 200 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  48.5 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  34.24 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  32.24 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.75 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 135 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 146 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 147 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 148 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 140 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 142 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  30.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  30.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.68 
 
 		 157 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 139 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.59 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 149 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30.7 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 151 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1440  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>