90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0565 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  85.48 
 
 		 191 aa  315  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  37.64 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  34.32 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  40.59 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30.06 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  29.34 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  28.31 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  29.58 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.86 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  32.8 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.68 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 173 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 146 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 164 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.43 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  22.36 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>