174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1440 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1440  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  273  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.27 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  40.85 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  27.36 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  32.32 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  30.21 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  22.66 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 155 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  43.5  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.8 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  28.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>