More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1031 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  358  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  89.41 
 
 		 175 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  79.39 
 
 		 175 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 168 aa  252  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  72.15 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 170 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  46.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  28.8 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  31.82 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  31.82 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  32.26 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.07 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  27.36 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.72 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.71 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  27.72 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  29.81 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>