More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1184 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 169 aa  258  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  78.67 
 
 		 175 aa  253  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 173 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  80.82 
 
 		 175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  78 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 170 aa  243  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  44.44 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.03 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  25.31 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  29.2 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  29.46 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.46 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2534  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.69 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.73 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.67 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.57 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>