More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2288 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
140 aa  269  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  55.28 
 
 
145 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  46.67 
 
 
169 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
142 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
142 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
142 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
142 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  40.91 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  44.95 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
156 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  36.28 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
194 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.09 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
303 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  37.39 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
244 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  43.82 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
155 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.64 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.75 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  33.03 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.74 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  39.34 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.9 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  29.01 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  39.01 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  39.84 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.25 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.25 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
186 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  38.24 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>