More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1828 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  42.18 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 175 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 315 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 184 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.91 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.86 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  44.94 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  42.7 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  36.11 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>